荧光原位杂交(FISH)
试剂和设备
- 20X 柠檬酸钠缓冲液(SSC:3 M NaCl,0.3 M柠檬酸钠,pH 7,货号S6639)
- RNase A(货号R4642)100 µg/mL,2x SSC溶液
- 胃蛋白酶(货号P6887) 40单位/ml,10 mM HCl溶液
- 多聚甲醛,EM级(货号P6148),现制,4% w/v水溶液
- 乙醇
- 标记的探针。通过缺口平移随机引物或 A3803聚合酶链反应(如ADVANCE™缺口平移试剂盒)而对质粒DNA进行生物素-11-dUTP标记
- 杂交混合液:50%甲酰胺(货号F7508)、10%硫酸葡聚糖(货号D8906)、0.1% SDS(货号L4390)、0.5-1.5 ng/µl标记的探针和300 ng/mL鲑鱼精子DNA(货号D7656),2x SSC溶液
- 洗涤缓冲液:20%甲酰胺(货号F7508),0.1x SSC溶液
- 检测缓冲液:0.2% Tween 20(货号. P1379),4x SSC溶液
- 封闭缓冲液:5% 牛白蛋白(货号A3803),检测缓冲液溶液
- 抗体或检测化合物(如链霉亲和素-Cy3,货号S6402),封闭缓冲液溶液
- DAPI(货号D9542),2 µg抗荧光淬灭封片剂溶液。
- 荧光显微镜、滤光片和可选的三带通滤波器(x58,Omega Optics)
- 玻片(货号S8400)
- 用于孵育和杂交步骤的塑料盖玻片(从可高压灭菌的垃圾袋切下,如货号B4408)
- 热模块/ 改进的热循环仪
- 用于洗涤步骤的科普林缸(货号S6016、S5641 或S5891)
操作流程
- 从任何细胞类型开始染色体制备。
- 在37 °C下用200 µL RNase孵育1小时
- 在2x SSC中洗涤玻片5分钟。重复。
- 在10 mM HCl中漂洗玻片。
- 在37 °C下用200 µL胃蛋白酶孵育10分钟。
- 在去离子H2O中漂洗玻片。
- 在2x SSC中洗涤玻片5分钟。重复。
- 在多聚甲醛中固定玻片10分钟。
- 在2x SSC中洗涤玻片5分钟。重复。
- 在梯度乙醇中对玻片进行脱水:70%、80%、95%;每种2分钟。
- 风干。
- 每块玻片制备30 µl杂交溶液。加热至70 °C,维持10分钟后置于冰上。
- 每块玻片上加入30 µl杂交溶液并盖上塑料盖玻片。
- 在热模块上65-70 °C条件下对玻片进行变性5分钟。
- 逐渐降温至37 °C。
- 在湿度箱37 °C条件下杂交过夜。
- 在2x SSC中洗涤玻片以去除盖玻片。
- 在洗涤缓冲液中40 °C条件下洗涤玻片5分钟。重复。
- 在0.1x SSC中40 °C条件下洗涤玻片5-15分钟。
- 在2x SSC中40 °C条件下洗涤玻片5-15分钟。
- 将玻片冷却至室温。
- 在检测缓冲液中平衡玻片5分钟。
- 在封闭缓冲液中封闭20-30分钟。
- 用50 µl 抗体或检测化合物孵育30-60分钟(如在封闭缓冲液中的5 µg/ml 链霉亲和素-Cy3)。
- 在2x SSC中洗涤玻片5分钟。重复两次。
- 用DAPI溶液复染10分钟。
- 简短漂洗后在抗荧光淬灭封片剂中进行封片。
- 用荧光显微镜进行分析。
产品列表
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参考文献
1.
Heslop-Harrison J, Schwazarcher T, Anamthawat-Jónsson K, Leitch AR, Shi M. 1991. In situ hybridization with automated chromosome denaturation. Technique. 3109-15.
2.
Leitch AR. 1994. In situ hybridization : a practical guide. Oxford (England): BIOS Scientific Publishers.
3.
Harris N, Oparka KJ. 1994. Plant Cell Biology: A Practical Approach. Oxford (England): Oxford University Press.
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