用于药物发现的DNA编码库技术
DNA编码化合物库(DNA-encoded library, DEL)高效筛选和发现有潜力的候选药物,革新药物发现技术。DEL相比传统的小分子化合物库具有多项优势,一次实验中筛选大量化合物、化学多样性高、筛选数据信息丰富。
我们的DyNAbind®创新DEL技术,可用于苗头化合物发现(hit identification)、先导化合物优化(lead optimization)和靶标鉴定(target deconvolution)。DEL试剂盒提供预组装化合物库、必要材料、实验方案和试剂,实现高通量筛选,最大限度地降低药物发现初期的成本和先导化合物发现时间。
我们的DEL产品种类:
DYNA001 DNA编码片段库,提高靶标筛选的准确度。基于片段的药物发现采用低分子量的小分子化合物或片段作为药物设计的起点。DEL与靶标进行筛选,获得苗头片段,再用来合成更大的化合物。
DYNA002 1千万化合物的DNA编码库试剂盒,含有至少1千万结合特定靶标的小分子化合物。试剂盒包含2管或5管试剂,经过优化的浓度使每管适合一次实验条件。库成本包括生成50个苗头化合物,或最多60个苗头化合物。所有苗头化合物的结构揭示无需额外费用,苗头化合物的研发或生产使用也不需要额外的许可费。
DELDATA 提供DYNA002筛选获得的所有苗头化合物的详尽信息。这个数据包可作为催化剂,用于高级预测模型的开发、算法优化和AI先导化合物发现的机器学习策略。
工作原理
在DNA编码库中,每个化合物结构都与一段独特的DNA序列相连用于索引。这段DNA标记编码了相连化合物的结构信息,使每个结构都有可识别的独特身份。于是DEL技术可以构建由不同结构组成的海量化合物库。筛选时,将DEL库与靶标蛋白(例如,与疾病有关的酶或受体)共同孵育。与蛋白具有结合力的化学结构带着DNA标记结合上靶标。结合后,洗掉不结合的化合物,仅留下成功结合靶标的结构。接着,对成功结合靶标结构的DNA标记进行二代测序,鉴定与靶标作用的化合物身份,揭示潜在的候选药物。
主要优点
- 高化学多样性:由于可以同时编码和筛选大量化合物,DEL技术具有极高的化学多样性。这种高多样性有利于探索更广阔的化学空间,提高新型和潜在化合物的发现几率。
- 高通量筛选:DEL可在一次实验中同时筛选数百万至数十亿化合物,实现苗头化合物的快速发现。这种高通量筛选能力有助于加快先导化合物的发现进程,缩短潜在候选药物的发现时间。
- 节约时间和成本:使用DNA编码库可减少筛选材料用量,免除单独化合物的纯化和操作工序,简化流程并降低耗费。
DEL应用
DEL十分适合靶标验证研究,研究人员可通过这项技术发现和验证潜在药物靶点。DEL也可用于基于片段的先导化合物生成,通过筛选适合靶标的小分子片段来发现待优化的先导化合物。此外,DNA编码库也适合生物化学研究,帮助了解靶标相互作用、鉴定蛋白质互作、探索新化学空间。
相关资源
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Aldrichimica Acta issue focused on DNA-Encoded Libraries
- Shaping the Future of Drug Discovery with DNA-Encoded Libraries
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