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U211000

Sigma-Aldrich

DMT-2′O-TBDMS-rU 亚磷酰胺

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别名:
5′-O-[双（4-甲氧基苯基）苯基甲基]-2′-O-[（1,1-二甲基乙基）二甲基甲硅烷基]-尿苷，3′-[2-氰基乙基 N,N-双（1-甲基乙基）亚磷酰胺], DMT-2′-O-TBDMS-rU酰胺
经验公式（希尔记法）:
C45H61N4O9PSi
CAS号:
118362-03-1
分子量:
861.05
MDL编号:
MFCD00080343
UNSPSC代码:
12352200
PubChem化学物质编号:
329827595
NACRES:
NA.51

生物来源

non-animal source (no BSE/TSE risk)

质量水平

300

产品线

Proligo Reagents

检测方案

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

形式

powder

杂质

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC)
≤3 wt. % residual Solvent content

颜色

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

适用性

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

核苷分析

base: uridine
base protecting group: none
2' protecting group: TBDMS
5' protecting group: DMT
deprotection: fast/standard

储存温度

−20°C

SMILES字符串

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O[Si](C)(C)C(C)(C)C)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(=O)NC3=O)(c4ccccc4)c5ccc(OC)cc5

InChI

1S/C45H61N4O9PSi/c1-31(2)49(32(3)4)59(55-29-15-27-46)57-40-38(56-42(48-28-26-39(50)47-43(48)51)41(40)58-60(10,11)44(5,6)7)30-54-45(33-16-13-12-14-17-33,34-18-22-36(52-8)23-19-34)35-20-24-37(53-9)25-21-35/h12-14,16-26,28,31-32,38,40-42H,15,29-30H2,1-11H3,(H,47,50,51)/t38-,40-,41-,42-,59?/m1/s1

InChI key

SKNLXHRBXYGJOC-ZMHKPELYSA-N

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相关类别

一般描述

DMT-2′O-TBDMS-rU亚磷酰胺属于2′O-TBDMS RNA亚磷酰胺。

应用

RNA干扰（RNAi）已成为一种流行的基因表达序列特异性抑制工具，可用于靶标验证和其他药物开发技术。提供序列特异性RNA寡核苷酸最便捷的方法是在固相支持体上用RNA磷酰胺和RNA CPG进行化学合成，类似于DNA合成。

特点和优势

  • 工业标准2′O-TBDMS保持基团
  • 批次间一致的纯度和性能
  • 兼容基于甲胺或AMA的去保护法
  • 当与ETT或BTT一起作为活化剂使用时，标准RNA亚磷酰胺可实现优异的耦合效果；使用活化剂42可获得最佳结果
  • 使用标准乙酸酐盖帽剂而非Fast Deprotection Cap A封盖
  • 在ISO 9001质量体系认证下生产

其他说明

RNA的独特性质刺激了各种诊断和治疗应用的发展，以及在基础分子生物学研究中，RNA可以用作：
  • 催化剂（核酶）
  • 亲和配体（适配体）
  • 诱导基因沉默（RNA干扰）的试剂

WGK

WGK 3

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Not applicable

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