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Merck
CN

G115000

Sigma-Aldrich

DMT-dG(dmf) Phosphoramidite

≥99.0% (reversed phase HPLC)

别名:

DMT-dG(dmf) Amidite, N-[(二甲基氨基)亚甲基]-5′-O- [双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2′-脱氧鸟苷,3′-[2-氰基乙基N,N-双(1-甲基乙基)亚磷酰胺], N2-二甲基甲脒基-5′-O-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-2′-脱氧鸟苷-3′-O-[O-(2-氰基乙基)-N,N′-二异丙基亚]

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About This Item

经验公式(希尔记法):
C43H53N8O7P
分子量:
824.90
MDL编号:
UNSPSC代码:
12352200
PubChem化学物质编号:
NACRES:
NA.51

类型

for DNA synthesis

质量水平

产品线

Proligo Reagents

检测方案

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

形式

powder

分子量

824.90 g/mol

技术

oligo synthesis: suitable

颜色

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

核苷分析

base: deoxyguanosine
base protecting group: DMF
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: fast

储存温度

-10 to -25°C

SMILES字符串

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(\N=C/N(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C43H53N8O7P/c1-29(2)51(30(3)4)59(56-24-12-23-44)58-36-25-38(50-28-45-39-40(50)47-42(48-41(39)52)46-27-49(5)6)57-37(36)26-55-43(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(53-7)20-16-32)33-17-21-35(54-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H,47,48,52)/b46-27-/t36-,37+,38+,59?/m0/s1

InChI key

YRQAXTCBMPFGAN-UJASEYITSA-N

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一般描述

DMT-dG(dmf)磷酰胺属于快速脱保护磷酰胺,其中自动合成寡核苷酸的脱保护步骤对合成时间和最终产品质量至关重要。将dG保护基团改为二甲基甲脒(dmf)基保护基团,可以快速合成高纯度、高产率的寡核苷酸,从而提高了高通量生产效率。

特点和优势

dG(dmf)主要特点:
  • dG(dmf)的脱保护速度高于常规dG(ib):在浓氨中,55 °C时的脱保护时间缩短为2小时,65 °C时的脱保护时间缩短为1小时
  • dG(dmf)-单体特别适用于富含g的序列:与传统的dG(ib)-单体相比,dG(dmf)-单体大幅减少了不完全脱保护
  • dG(dmf)-亚磷酰胺在溶液中的稳定性与标准的dA(bz)-、dC(bz)-和dt -酰胺磷一样
  • dG(dmf)-亚磷酰胺可直接取代dG(ib)-亚磷酰胺
  • DNA合成的常用试剂不需要改变(除了使用低浓度的碘氧化剂,即0.02 M的碘)。

WGK

WGK 3

闪点(°F)

Not applicable

闪点(°C)

Not applicable


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