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Merck
CN

C111000

Sigma-Aldrich

DMT-dC(bz)亚磷酰胺

别名:

DMT-dC(bz)酰胺, N-苯甲酰-5′-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2′-脱氧胞苷, 3′-[2-氰乙基N,N-?双(1-甲基乙基)亚磷酰胺], N4-苯甲酰-5′-O-(4,4′-双甲氧基三基)-2′-脱氧胞苷-3′-O-[O-(2-氰乙基)-N,N′-二异丙基亚磷酰胺], 胞啶, N-苯甲酰-5′-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2′-脱氧-, 3′-[2-氰乙基 双(1-甲基乙基)亚磷酰胺]

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About This Item

经验公式(希尔记法):
C46H52N5O8P
分子量:
833.91
MDL编号:
UNSPSC代码:
41116107
PubChem化学物质编号:
NACRES:
NA.51

生物来源

non-animal source (no BSE/TSE risk)

质量水平

类型

for DNA synthesis

产品线

Proligo Reagents

检测方案

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

形式

powder or granules

技术

oligo synthesis: suitable

杂质

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer)

颜色

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

核苷分析

base: deoxycytidine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

储存温度

2-8°C

SMILES字符串

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(NC(=O)c4ccccc4)=NC3=O)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C46H52N5O8P/c1-32(2)51(33(3)4)60(57-29-13-27-47)59-40-30-43(50-28-26-42(49-45(50)53)48-44(52)34-14-9-7-10-15-34)58-41(40)31-56-46(35-16-11-8-12-17-35,36-18-22-38(54-5)23-19-36)37-20-24-39(55-6)25-21-37/h7-12,14-26,28,32-33,40-41,43H,13,29-31H2,1-6H3,(H,48,49,52,53)/t40-,41+,43+,60?/m0/s1

InChI key

PGTNFMKLGRFZDX-SALLYJDFSA-N

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一般描述

DMT-dC(bz)亚磷酰胺是一种DNA亚磷酰胺。主要特点如下:
  • 环外氨基由苯甲酰基(dA(bz)和dC(bz))或异丁酰基(dG(ib))保护
  • 对于标准碱基保护寡核苷酸,建议的切割和脱保护条件为采用浓氨水,在55°C反应8小时或室温24小时
  • Proligo′s DNA亚磷酰胺的高偶联效率有助于得到高产、高质量的寡核苷酸

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