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Merck
CN

XBAI-RO

Roche

Xba I

from recombinant E.Coli

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UNSPSC代码:
12352204

生物来源

Escherichia coli

质量水平

形式

solution

包装

pkg of 1,000 U (10674257001 [10 U/μl])
pkg of 20,000 U (10674273001 [10 U/μl])
pkg of 20,000 U (11047663001 [40 U/μl])
pkg of 5,000 U (10674265001 [10 U/μl])

制造商/商品名称

Roche

参数

37 °C optimum reaction temp.

技术

DNA sequencing: suitable

储存温度

−20°C

一般描述

Xba I可识别序列T↓*CTAGA并产生具有 5′-粘性末端的片段。该酶在切割位点之前,需要目标序列周围至少有两个核苷酸。

相容末端
Xba I末端与Avr I、Nhe I和Spe I生成的片段相容。

同裂酶
尚不清楚该酶是否具有同裂酶。

甲基化敏感性
DNA的Xba I消化受到大肠杆菌的dam基因产物的抑制,该基因产物使GATC序列中腺嘌呤的6N位置甲基化。在识别序列的标注位点 (*) 上的5-甲基胞嘧啶或5-羟甲基胞嘧啶也能抑制该酶活性。

在SuRE/Cut缓冲液体系中的活性
建议使用粗体印刷的缓冲液以获得最佳活性:
A B L M H
100% 75-100% 75-100% 75-100% 100%

在完全PCR混合液中的相对活性
在PCR混合液(Taq DNA聚合酶缓冲液)中的相对活性为60%。PCR混合液含有?DNA、引物、10mM Tris-HCl(pH 8.3,+20°C)、50mM KCl、1.5mM MgCl2、200 ?M dNTP、2.5 U Taq DNA聚合酶。该混合液可用于25个扩增循环。在Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液的反应缓冲液中的活性为25%。当补充GC-RICH溶液时,活性增加至100%。

孵育温度
+37°C


不同DNA的切割位点数量
λ Ad2 SV40 ?X174 M13mp7 M13mp18 pBR322 pBR328 pUC18
1 5 0 0 0 1 0 0 1

经PFGE测试
Xba I已经过脉冲场凝胶电泳(在细菌染色体上)测试。对包埋在PFGE分析用琼脂糖中的基因组DNA(大肠杆菌C 600)进行切割时,我们建议每 ?g DNA使用10 U酶,孵育时间约为4小时。

连接和再酶切测定
将通过完全消化1 ?g pUC18 DNA获得的Xba I片段与10 ?l的1U T4 DNA连接酶连接,连接方法是在66 mM Tris-HCl溶液(含 5 mM MgCl2、5 mM二硫苏糖醇、1 mM ATP,在+20°C下pH 7.5)中在+ 4℃下孵育16小时,得到pUC18 DNA回收率高于90%。
随后用Xba I重新酶切,得到高于95%的典型pUC18×Xba I片段。

特异性

星号活性
在低离子强度下或向孵育混合液中添加甘油、乙醇或DMSO,会降低Xba I的序列特异性。
识别位点:TCTAGA
TCTAGA
限制性位点:T↓CTAGA
T↓CTAGA
热灭活:通过在65℃温育15分钟(最多15 U/μg DNA),可将Xba I热灭活。这些条件不能使较高浓度的Xba I完全热灭活。

应用

限制酶Xba I已被用于基因组DNA的消化。

DNA图谱分析

不同DNA的切割位点数量
  • λ:1
  • φX174:0
  • Ad2:5
  • M13mp7:0
  • pBR322:0
  • pBR328:0
  • pUC18:1
  • SV40:0

单位定义

一个酶活性单位是指在+37 °C下,在总体积为50 μl的(1x) SuRE/Cut 缓冲液 H中,在一小时内完全裂解1 μg λdam DNA所需的酶量。

分析说明

SuRE/Cut 缓冲液体系
建议使用粗体印刷的缓冲液以获得最佳活性
  • A:100%
  • B:75-100%
  • H:100%
  • L:75-100%
  • M:75-100%

无非特异性核酸内切酶活性
将1μg λDNA 与过量的Xba I一起在50 μl SuRE/Cut 缓冲液H中孵育16小时。分析证书提供了不改变酶特异性模式的酶单位数量。

无核酸外切酶活性
将大约5 μg [3H]标记的小牛胸腺DNA与3μl Xba I一起溶于总体积为100 μl的50mM Tris-HCl溶液(含10 mM MgCl 2、1mM二硫赤藓糖醇,pH约7.5)中 并在+ 37℃下孵育4小时。根据分析证书所述,在这些条件下,检测不到放射性释放。
在PCR缓冲液中的活性:60%

在PCR混合液(Taq DNA聚合酶缓冲液)中的相对活性为60%。PCR混合液含有λDNA、引物、10mM Tris-HCl(pH 8.3,20℃)、50mM KCl、1.5mM MgCl2、200 μM dNTP、2.5 U Taq DNA聚合酶。该混合液可用于25个扩增循环。在Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液的反应缓冲液中的活性为25%。当补充GC-RICH溶液时,活性增加至100%。Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液不在美国出售。

其他说明

仅用于生命科学研究。不可用于诊断。

仅试剂盒组分

产品编号
说明

  • Enzyme Solution

  • SuRE/Cut Buffer H 10x concentrated

储存分类代码

12 - Non Combustible Liquids

WGK

WGK 1

闪点(°F)

does not flash

闪点(°C)

does not flash

法规信息

常规特殊物品

分析证书(COA)

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W J M Landman et al.
Avian pathology : journal of the W.V.P.A, 43(4), 345-356 (2014-06-20)
Escherichia coli colonies isolated from the bone marrow of fresh dead hens of laying flocks with the E. coli peritonitis syndrome (EPS) were genotyped using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Typing is important from an epidemiological point of view and also

商品

The term “Restriction enzyme” originated from the studies of Enterobacteria phage λ (lambda phage) in the laboratories of Werner Arber and Matthew Meselson.

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