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17-10499

Sigma-Aldrich

Magna MeRIP m6A试剂盒- N6-甲基腺苷的全转录组谱图分析

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NA.84

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一般描述

N6-甲基腺苷(m6A)是一种丰富的RNA修饰,在从植物到酵母,再到哺乳动物的许多不同物种中得以保留。与DNA的5-甲基胞嘧啶(5-mc)修饰类似,m6A是RNA的可逆化学修饰。m6A RNA修饰是控制哺乳动物胚胎干细胞细胞命运转变的一个新兴课题。m6A是真核生物中mrna和非编码rna上最普遍的修饰之一,估计在7000多个基因中有12000个m6A位点。标记通过甲基转移酶样3和14(Mettl3和Mettl14)的异源二聚体沉积,并可通过RNA去甲基化酶FTO和ALKBH5去除。肥胖风险基因FTO编码第一个确定的m6A去甲基化酶。FTO的突变与肥胖和II型糖尿病的风险增加有关。最近,m6A调控状态的损害导致Nanog在ES细胞中的表达延长,并且无法退出自我更新阶段走向分化。

甲基化(m6A) RNA免疫沉淀(MeRIP)是一种监测m6A状态和绘制m6A RNA修饰转录组位置的方法。Magna MeRIP M6A试剂盒使用MeRIP方法对M6A RNA修饰进行鉴定和转录组分析。在MeRIP检测中,RNA被化学分割成100个核苷酸或更小的片段,然后用针对m6A的单克隆抗体进行磁免疫沉淀。免疫沉淀后,分离的RNA片段可进行qRT-PCR或RNA测序(MeRIP-seq)。简化协议易于处理,可以产生高SN比的结果。

应用

Magna MeRIP m6A Kit简化了MeRIP(甲基化RNA免疫沉淀)方法,能够鉴定和转录组范围内的m6A(N6-甲基腺苷)RNA甲基化位点。适用于甲基化RNA转录物的MeRIP-Seq和qRT-PCR。

组分

RNA片段缓冲液10X (0.5 mL);0.5 m EDTA (0.5 mL);IP缓冲液5X (15 mL);磁珠A/G混合物(315 μL);抗-N6-甲基腺苷(m6A),克隆17-3-4-1 (100 μG);RNase抑制剂(90 μL);N6-甲基腺苷,5′-单磷酸钠盐(m6A) (10 mg);正常小鼠IgG (125 μg);MeRIP引物人EEF1A1阳性(75 μL);MeRIP引物人EEF1A1阴性(75 μL)

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