用于活细胞 RNA 结构分析的体内形状试剂

特点&优点

• 即用型无RNase溶液
• 低毒性允许与活细胞一起使用
• 高细胞渗透性用于RNA的快速修饰
• 与所有RNA核苷酸反应而无偏倚用于高消退作图

体内SHAPE试剂用于RNA结构的测定。该试剂含有高纯度形式的2-甲基烟酸咪唑化物（NAI）。该化合物在RNA的单链区域上形成2’-O-加合物，可以通过选择性2’-羟基酰化和引物延伸（SHAPE）进行检测。

与用于SHAPE方法的其他试剂相比，基于–NAI的体内SHAPE试剂可迅速吸收到细胞中，并配制成具有低水平的毒性，因此非常适合与活细胞一起使用。与用于SHAPE分析的其他试剂不同，体内SHAPE试剂与所有四个RNA核苷酸均以无偏方式反应。这种低毒性，快速摄取和缺乏核苷酸偏倚的结合使得能够在多种生命系统中进行高消退RNA结构分析。

折叠成更高阶的结构可使RNA在活细胞内部起作用，并与效应蛋白形成动态复合物。预测这些3D结构具有挑战性，因此已经开发了许多探测技术来研究RNA折叠。

含有体内SHAPE试剂的化合物（例如2-甲基烟酸咪唑化物（NAI））导致形成2-O-加合物。这些加合物在单链未配对RNA上快速形成，而在基于配对（双链）RNA上形成的速度要慢得多。然后可以通过引物延伸分析修饰的RNA。修饰的核苷酸不会被RNA依赖性DNA聚合酶延伸，因此可以检测修饰位点。

DMSO中的2-甲基烟酸咪唑化物（NAI）

通过HPLC法检测NAI化合物的纯度。

DMSO中的2M NAI

含2M NAI（>97%纯度）的DMSO溶液的0.5 mL小瓶

将NAI储存在-20°C的非无霜冰箱中，避光保存。经过适当的储存（避光并避免过度的冻融循环），该产品自接收之日起可稳定长达6个月。

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

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