聚丙烯酰胺凝胶通过丙烯酰胺与双丙烯酰胺(N,N’-亚甲基双丙烯酰胺)的反应形成,产生高度交联的凝胶基质。凝胶充当筛子,蛋白质在电场作用下通过这个筛子。蛋白质总体带正电或负电,这使得蛋白质分子能够朝向等电点移动,在等电点分子没有净电荷。通过使蛋白质变性并赋予它们均匀的负电荷,可以在它们向正电极迁移时基于它们的大小分离它们。
图 1.蛋白质样品和色同步蛋白标记物的SDS-PAGE(C1992)
实验方案
所需材料和试剂
- 包含电源、玻璃板、垫片和点样梳的垂直电泳室
注意:丙烯酰胺和双丙烯酰胺在性质上具有神经毒性。所有步骤均应佩戴无粉手套进行。
制备凝胶
- 用去离子水和乙醇清洁凝胶浇注装置的玻璃板和垫片。
- 将玻璃板和垫片组装在稳定、平整的表面上。
- 根据所需凝胶的百分比,使用以下体积制备分离凝胶溶液(制成体积为10 mL)。
- 将凝胶溶液倒入组装了垫片的玻璃板中。为了使分离凝胶表面保持均匀和水平,用水或异丙醇(I9516)间隔表面。
- 让凝胶在室温下凝固约20-30分钟。
- 使用以下体积制备积层凝胶溶液(制成体积为10 mL):
* TEMED必须最后添加。
样品制备
- 在一定体积的蛋白质样品(细胞或组织裂解液)中,加入等体积的上样缓冲液。
- 将上述混合物在95°C下煮沸5分钟,16000G离心5分钟。
- 这些样品可以在-20°C下储存,也可以用于进行凝胶电泳。
凝胶染色
考马斯蓝染色:用考马斯亮蓝R-250染色蛋白质凝胶是显示通过SDS-PAGE分离的蛋白质的常用方法。它非常灵敏,适合长期储存凝胶。
所需试剂
- 凝胶固定液 (500 mL)
甲醇 (M3641) 250 mL
冰醋酸 (695092) 50 mL
水 200 mL
- 考马斯溶液
CBB R-250 (B6529) 0.1%
甲醇 (M3641) 40%
冰醋酸 (695092) 10%
使用Whatmann 1号滤纸过滤染色溶液。
- 脱色溶液
甲醇 (M3641) 50 mL
冰醋酸 (#695092) 35 mL
- 凝胶储存溶液
冰醋酸 (695092) 25 mL
水 475 mL
操作流程
- 电泳后,将凝胶放入含有凝胶固定溶液的塑料托盘中。将托盘放在摇床上固定蛋白质2小时。
- 丢弃凝胶固定溶液,然后加入考马斯溶液。 放在摇床上,将凝胶染色2-4小时。
- 染色步骤后,用蒸馏水洗涤凝胶数次,以去除多余的染料。
- 将脱色溶液添加到凝胶。放在摇床上脱色约4个小时,直到可以看到清晰背景上的清晰蓝色条纹。
- 脱色后,可将凝胶储存在凝胶储存溶液中,并根据需要拍照。
银染
我们提供适用于SDS-PAGE凝胶的高灵敏度蛋白质检测银染试剂盒。还需要以下试剂:
操作流程
- 电泳后,将凝胶浸入固定溶液40分钟。在固定溶液中浸泡过夜能产生更清晰的背景。
- 丢弃固定溶液,用30%乙醇溶液洗涤凝胶10分钟,然后用超纯水洗涤10分钟。
- 倒出水,并将凝胶在敏化剂溶液中孵育10分钟。
- 丢弃敏化剂溶液,用水洗涤凝胶两次,每次洗涤持续10分钟。
- 倒出水,并将凝胶浸泡在银溶液中10分钟。
- 倒掉银溶液,并在水中洗涤凝胶1.5分钟。
- 倒掉水,将凝胶浸入显影液中3至7分钟。
- 向显影液中加入5 mL终止液,孵育5分钟。丢弃显影液/终止液,在超纯水中洗涤凝胶15分钟。
- 这时凝胶可以拍照,也可以储存在新鲜的超纯水中。
双重染色:使用CBB R-250对凝胶进行染色,然后使用上述步骤进行银染色。
荧光染色:我们为蛋白质电泳提供荧光SYPRO和Lucy染色剂。可以在黑暗中将凝胶浸入荧光染色剂中,或者在电泳过程中将凝胶与阴极缓冲液混合。
染色实验方案取决于所使用的染色剂,可以在此处找到:
- SYPRO® 宝石红蛋白质凝胶染色剂 (PDF)
- LUCY® 506 溶液 (PDF)
可逆凝胶染色
可逆凝胶染色使用户能够在SDS-PAGE后进行蛋白质的蛋白质免疫印迹。
R-PROB染色:R-PROB是一种独特的染色剂,可用来检测PAGE凝胶和西方蛋白质印迹上的蛋白质。
所需试剂:
- 用于膜和聚丙烯酰胺凝胶的可逆蛋白质检测试剂盒(RPROB)
- 固定溶液(F7264)
- 10% 醋酸
- EDTA 50 mM
操作流程
- 将电泳后的凝胶浸入固定溶液中20分钟。重复此步骤两次。
- 在水中冲洗凝胶两次,每次冲洗持续30分钟。
- 将凝胶在染色溶液中孵育20-40分钟,同时轻轻搅拌。
- 用10%醋酸洗去多余的染色剂。
- 脱色:用EDTA洗涤凝胶,然后在水中或固定溶液中洗涤15分钟,洗两次。
铜染色:为了确认蛋白质的迁移和分离,凝胶可以用可逆染色剂(如CuCl2)染色。
所需试剂
- 0.3 M CuCl2溶液
- 0.25 M Tris和0.25 M EDTA溶液
操作流程
- 将电泳后的凝胶用蒸馏水冲洗最多30分钟。
- 将凝胶浸入0.3 M CuCl2溶液中10分钟。
- 用去离子水冲洗。
- 蛋白质可以在蓝色背景上显示为清晰的区域。
- 脱色:反复在0.25 M Tris和0.25 M EDTA溶液(pH 9)中洗涤染色的凝胶。
- 在进行后续的转印操作之前,将脱色后的凝胶转移至转印缓冲液中。
图 2.印迹和垂直电泳系统
如果需要在电泳后将蛋白质转印到膜上,在此处可以找到实验方案。
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参考文献
1.
Sambrook J, Fritsch T, Maniatis T. 1989. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 1. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
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